MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis P54B96 chromosome

Total Repeats: 6538

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017031	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017031	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017031	AAC	2	6	2251	2256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017031	TGC	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017031	GAG	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017031	GAG	2	6	3491	3496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017031	CTG	2	6	3593	3598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017031	TAA	2	6	5543	5548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017031	A	6	6	7623	7628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017031	TAG	3	9	7672	7680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017031	ATG	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017031	TA	4	8	8188	8195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017031	GTT	2	6	8207	8212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017031	CAA	2	6	8237	8242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017031	TCGC	2	8	8249	8256	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017031	TTC	2	6	8264	8269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017031	T	6	6	8286	8291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017031	TTA	2	6	8409	8414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017031	TGC	2	6	12020	12025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017031	GTT	2	6	12090	12095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017031	GT	3	6	12100	12105	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017031	AAC	2	6	12254	12259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017031	AGG	2	6	12300	12305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017031	TGT	2	6	12369	12374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017031	GAA	2	6	13213	13218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017031	GCC	2	6	13222	13227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017031	T	7	7	13262	13268	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017031	GT	3	6	13328	13333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017031	GGT	2	6	13360	13365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017031	T	6	6	13377	13382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017031	GAC	2	6	13461	13466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017031	CAA	2	6	13489	13494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017031	CAT	2	6	13499	13504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017031	TTATC	2	10	14085	14094	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017031	TGT	2	6	14157	14162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017031	ACGTA	2	10	14248	14257	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017031	AGG	2	6	14327	14332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017031	CAGTA	2	10	14631	14640	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017031	GCA	3	9	15713	15721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017031	CCA	2	6	15744	15749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017031	CGA	2	6	15754	15759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017031	CGG	2	6	15770	15775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017031	A	6	6	17565	17570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017031	TAGCG	2	10	18329	18338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017031	GAA	2	6	20100	20105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017031	GAAA	2	8	20225	20232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017031	TGG	2	6	20281	20286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017031	GCT	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017031	CGA	2	6	20406	20411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017031	CAG	2	6	20559	20564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017031	AGT	2	6	21033	21038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017031	GAG	2	6	21203	21208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017031	GAT	2	6	21319	21324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017031	GCA	2	6	21365	21370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017031	AGCTTC	2	12	21470	21481	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017031	GCT	2	6	21859	21864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017031	ATG	2	6	21891	21896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017031	TTCC	2	8	21948	21955	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017031	AGT	2	6	21961	21966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017031	AGT	2	6	21970	21975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017031	AGC	3	9	21988	21996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017031	G	7	7	21997	22003	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017031	GTT	2	6	22054	22059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017031	TTTTCT	2	12	22072	22083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017031	TC	3	6	22600	22605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017031	TAT	2	6	22631	22636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017031	AAT	2	6	23702	23707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017031	AGC	2	6	23709	23714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017031	T	6	6	23760	23765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017031	TCAT	2	8	23816	23823	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017031	TGAT	2	8	23834	23841	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017031	CT	3	6	23875	23880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017031	TTG	2	6	24076	24081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017031	GTG	2	6	26847	26852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017031	CCG	2	6	26881	26886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017031	CAG	3	9	26897	26905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017031	GCTA	2	8	29127	29134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017031	TC	3	6	29155	29160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017031	TAT	2	6	29173	29178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017031	TA	3	6	29533	29538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017031	GAG	2	6	37968	37973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017031	CCT	2	6	39008	39013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017031	TACT	2	8	39034	39041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017031	GCA	2	6	39070	39075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017031	TAG	2	6	39110	39115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017031	AAGA	2	8	39116	39123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017031	ATT	2	6	39329	39334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017031	CAC	2	6	39339	39344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017031	C	7	7	39418	39424	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
90	NC_017031	T	6	6	39496	39501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017031	TGCG	2	8	39566	39573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017031	CACAT	2	10	39585	39594	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_017031	TGT	2	6	40394	40399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017031	CCT	2	6	41359	41364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017031	TTC	2	6	41365	41370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017031	ATA	2	6	41390	41395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017031	TA	3	6	41394	41399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017031	GCTG	2	8	41453	41460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017031	TGA	2	6	41522	41527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017031	AATG	2	8	44448	44455	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017031	CG	3	6	44475	44480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017031	CCT	2	6	46035	46040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017031	ATT	2	6	46079	46084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017031	AAAT	2	8	46092	46099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017031	TGT	2	6	46143	46148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017031	TTGC	2	8	47821	47828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017031	AGC	2	6	47849	47854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017031	TTG	2	6	47865	47870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017031	GTT	2	6	47887	47892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017031	ATTA	2	8	47896	47903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017031	TTG	2	6	47975	47980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017031	ACT	2	6	48354	48359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017031	TGG	2	6	48422	48427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017031	TAT	2	6	48436	48441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017031	T	6	6	48459	48464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017031	T	6	6	49846	49851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017031	AAG	2	6	49859	49864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017031	TTC	2	6	50019	50024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017031	TCA	2	6	50034	50039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017031	T	6	6	50121	50126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017031	A	6	6	50185	50190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017031	GTG	2	6	50223	50228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017031	TCA	2	6	50232	50237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017031	AAG	2	6	50362	50367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017031	TAA	2	6	50621	50626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017031	ATC	2	6	50665	50670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017031	TGG	2	6	50844	50849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017031	CG	3	6	50856	50861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017031	AC	3	6	50870	50875	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017031	GTTT	2	8	50898	50905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017031	CTA	2	6	51000	51005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017031	CTC	2	6	51049	51054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017031	TGT	2	6	52655	52660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017031	TTGGA	2	10	52666	52675	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017031	AAC	2	6	52684	52689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017031	TTGAT	2	10	52701	52710	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017031	CTT	2	6	52777	52782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017031	TGCAC	2	10	52795	52804	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_017031	TGC	2	6	52808	52813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017031	TTG	3	9	52816	52824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017031	CGT	2	6	52825	52830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017031	GCC	2	6	52844	52849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_017031	AC	3	6	52924	52929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017031	CCA	2	6	54663	54668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017031	A	6	6	54676	54681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017031	GA	3	6	54735	54740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017031	TGG	2	6	57715	57720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017031	CAT	2	6	57760	57765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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150	NC_017031	TTGG	2	8	57804	57811	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017031	TGC	3	9	57859	57867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017031	CTT	2	6	59642	59647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017031	ACC	2	6	59648	59653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_017031	ACG	2	6	59663	59668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017031	GCAC	2	8	59675	59682	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
156	NC_017031	GAG	2	6	59707	59712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017031	T	7	7	61442	61448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017031	GT	3	6	71601	71606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017031	A	6	6	71625	71630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017031	CTT	2	6	71667	71672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_017031	TAAT	2	8	76524	76531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_017031	AG	3	6	125190	125195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
280	NC_017031	AAG	2	6	125203	125208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_017031	GTT	2	6	125311	125316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_017031	CTT	2	6	125323	125328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_017031	CAG	2	6	125369	125374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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285	NC_017031	CGGGA	2	10	125531	125540	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
286	NC_017031	AG	3	6	125562	125567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
287	NC_017031	CAG	2	6	125570	125575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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409	NC_017031	TCA	2	6	154776	154781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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414	NC_017031	T	6	6	154979	154984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_017031	TTCC	2	8	155747	155754	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
416	NC_017031	GTACC	2	10	155776	155785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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419	NC_017031	ACC	2	6	156762	156767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
420	NC_017031	TCC	2	6	156800	156805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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422	NC_017031	ATGC	2	8	157241	157248	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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424	NC_017031	AGA	2	6	157277	157282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_017031	GAG	2	6	163073	163078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_017031	T	6	6	163145	163150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017031	ATGC	2	8	164294	164301	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_017031	GAG	2	6	164337	164342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_017031	TGG	2	6	164394	164399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017031	TGTGC	2	10	164426	164435	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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461	NC_017031	AAT	2	6	169200	169205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_017031	TGTT	2	8	169254	169261	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017031	ATT	2	6	169312	169317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_017031	AAG	2	6	169465	169470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_017031	ATA	2	6	171363	171368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017031	GGGAC	2	10	171460	171469	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
473	NC_017031	AAAT	2	8	171491	171498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_017031	TTG	2	6	175149	175154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017031	TG	3	6	175169	175174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017031	TCG	2	6	175175	175180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_017031	ATAG	2	8	175219	175226	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
484	NC_017031	AC	3	6	175227	175232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_017031	GGC	2	6	175300	175305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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487	NC_017031	ATG	2	6	177418	177423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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